Née et élevée à Lake Orion dans le Minessota, Cynthia Watros s'est fait connaitre dans la série The Guilding Time pour laquelle elle a gagné en 1998 un Daytime Emmy Award. La même année, elle est devenue Erin dans la sitcom Titus jusqu'à son arrêt puis a enchainé en jouant dans une autre sitcom à succès, The Drew Carey Show.
Elle est aussi apparut dans les séries Spin City, Profiler et New-York Undercover. En 2005, elle est de retour au générique de la deuxième saison de Lost : Les Disparus, la série phénomène sur ABC.
Elle vit actuellement à Los Angeles avec son mari.